Atos anunció que la poderosa BullSequana X1000 instalada en el Centro Hartree del Consejo de Instalaciones Científicas y Tecnológicas (STFC), está proporcionando potencia de supercomputación para ayudar en los esfuerzos mundiales de descubrimiento de drogas para ayudar a combatir Covid-19.
El equipo del Centro Hartree trabaja en colaboración con la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington, que dirige el proyecto Folding@home, que permite a una comunidad mundial de colaboradores prestar capacidad no utilizada en sus computadoras personales para alimentar simulaciones de las interacciones de las drogas.
Si bien se dispone de mucha potencia de computación para ejecutar esas simulaciones, para crear las estructuras de las drogas que se van a simular se utilizan métodos complejos y de memoria intensiva que requieren supercomputadoras. Por lo tanto, la creación de estas estructuras de drogas se ha convertido en el cuello de botella en el uso de la enorme cantidad de potencia de cálculo disponible en Folding@home.
Utilizando parte de la capacidad de la supercomputadora Atos BullSequana X1000 del Centro Hartree, el equipo está acelerando este proceso y creando nuevas estructuras de drogas para ser simuladas completamente a través de la potencia de computación distribuida de Folding@home.
Los sistemas Atos BullSequana X1000 de Hartree también se están utilizando para apoyar la labor de CompBioMed, el Centro Europeo de Excelencia en Biomedicina Computacional, como parte de un esfuerzo mundial que incluye cientos de investigadores de los Estados Unidos y Europa para abordar diferentes aspectos de Covid-19.
Como medida provisional antes de que se pueda producir una vacuna, se necesitan productos farmacéuticos que puedan reducir la gravedad de la enfermedad o que puedan utilizarse como medida preventiva. Esto requiere que miles de compuestos sean examinados en forma de simulaciones avanzadas, lo que exige altos niveles de potencia de cálculo. Los sistemas del Centro Hartree se están utilizando como parte de un conjunto excepcional de supercomputadoras en todo el mundo que se están aprovechando para realizar estas simulaciones.
Alison Kennedy, Directora del Centro Hartree del STFC, expresó: «La forma en que funciona el proyecto folding@home es tomar un posible compuesto y utilizar simulaciones informáticas para ver cómo interactúa con el virus. No es una forma de proporcionar una vacuna, pero si se identifican los compuestos antivirales adecuados, podría ayudar a tratar a los pacientes que han contraído el virus, lo que podría ayudarles a mejorar más rápidamente y a reducir la carga de los servicios de atención sanitaria fundamentales».
El equipo espera identificar terapias antivirales que interrumpan una o más de las proteínas necesarias para el ciclo de vida de COVID-19, lo que ayudaría a prevenir una mayor propagación del virus.
Carlos Abril, CEO de Atos para la Región Austral Andina menciona “Atos ha estado siempre a la vanguardia en el desarrollo de supercomputadoras y es grato ver los esfuerzos y compromiso de la compañía a nivel global para desempeñar un papel clave desde nuestro conocimiento en lo que se ha convertido en un enorme esfuerzo internacional coordinado para investigaciones del tratamiento para el coronavirus».
